一般情况下，吃墨鱼的害处可能会表现在引起过敏反应、造成胃肠功能紊乱，增加痛风的风险以及等方面。故建议适量或少量吃墨鱼，以免危害机体健康。
1、引起过敏反应：对于部分易过敏体质的人群而言，吃墨鱼后，可能会引起过敏反应，可表现为恶心、呕吐、头晕等不适；
2、造成胃肠功能紊乱：由于墨鱼含有较多的蛋白质和部分脂肪，若进食过多，可能会加重胃肠负担，使胃肠功能受到影响，可出现腹胀、腹泻、腹痛等不适；
3、增加痛风的风险：墨鱼属于嘌呤含量较高的食物，若长期大量进食，可能会使机体嘌呤含量过多，可能会增加痛风的风险。而对于本身患有痛风的人群而言，可能会加重病情；
4、其他危害：由于墨鱼含有较多的胆固醇和钠元素，若长期过量食用，可能会使血脂水平增高。对于本身存在高脂血症的人群而言，还可能会导致病情加重。另外，若长期进食，可能会导致钠离子摄入过多，易引起血压波动，对高血压人群不利。